O Laboratório de Sistemas Térmicos está localizado no campus Itaguaí do CEFET/RJ, ocupa uma área de 57 m² no bloco B. O laboratório está preparado para atuar nas áreas de fenômenos de transporte, transferência de calor, mecânica dos fluidos, instrumentação e sistemas microeletromecânicos (MEMS). As linhas de pesquisa em destaque são análise de macrossistemas térmicos, análise de microssistemas térmicos, desenvolvimento de infraestrutura para criação de microssistemas, dinâmica dos fluídos, e sistemas microeletromecânicos. Possui bancada de trocadores de calor, bancada de refrigeração e bancada de mecânica dos fluidos. O laboratório conta ainda com hardwares e softwares da National Instruments, sensores, atuadores, entre outros para os mais diversos tipos de experimentos. Atualmente está em confecção uma câmara limpa de nível ISO-5 para fabricação, montagem e teste de micro e nano dispositivos.